Bioz est une plateforme commerciale qui applique l'intelligence artificielle à la découverte et à l'interprétation de la littérature scientifique dans les sciences de la vie. Fondée en 2013 et basée à Los Altos, en Californie, l'entreprise développe des outils logiciels pour aider les chercheurs à identifier les réactifs, les protocoles et les produits expérimentaux issus d'études publiées. La principale production de la plateforme est une base de données consultable de produits biologiques et pharmaceutiques, chacun annoté avec des preuves issues de textes intégraux, structurés pour un contexte expérimental.
L'entreprise a été fondée par Karin Lachmi, qui en est la PDG, et Ori Perlman, qui en est le directeur technique. Avant Bioz, Lachmi a travaillé dans la recherche universitaire et a cofondé une start-up de génétique, ce qui a éclairé son objectif de créer un outil réduisant les frictions liées à la recherche de matériel expérimental fiable. Perlman avait une expérience en ingénierie logicielle et en analyse de données. L'entreprise a levé environ 20 millions de dollars lors de plusieurs tours de financement, avec des investisseurs tels qu'Intel Capital, qui a participé à un tour de 12,5 millions de dollars en 2019.
Bioz concentre sa technologie sur le problème de la reproductibilité expérimentale. Des millions d'articles de recherche contiennent des descriptions incomplètes ou cachées de produits, ce qui rend difficile pour les scientifiques de reproduire les résultats. Bioz recherche dans le texte intégral des publications et utilise l'apprentissage automatique et l'apprentissage profond pour extraire et analyser les mentions de produits, tels que les réactifs, les anticorps, les kits et les équipements. Elle attribue ensuite à ces produits un score indiquant leur probabilité prédite de fonctionner dans un contexte expérimental donné.
Plateforme et technologie
La plateforme Bioz indexe des dizaines de millions de points de données provenant de plus de 25 millions d'articles de recherche en sciences de la vie. Grâce à des grands modèles de langage et à d'autres approches d'IA, elle traite les articles pour identifier les noms de produits, leurs relations avec les protocoles et les résultats des expériences. Le système intègre des outils de recherche qui permettent aux chercheurs de saisir une requête, et l'IA génère des résultats qui vont au-delà de la simple correspondance de mots-clés. Il classe ces résultats selon un « score Bioz » propriétaire, qui reflète la qualité prédite des preuves pour chaque produit utilisé dans un contexte spécifique.
La plateforme propose plusieurs produits clés, notamment Bioz Search, l'API Bioz et Bioz Solutions. Bioz Search est l'interface Web gratuite qui permet aux utilisateurs de rechercher des produits et d'obtenir des résultats contextualisés, y compris des résumés de preuves extraites d'articles. L'API Bioz permet aux organisations d'intégrer ces fonctions de recherche et de notation dans leurs propres systèmes internes, tels que les cahiers de laboratoire électroniques ou les systèmes de gestion de l'information de laboratoire. Bioz Solutions est une suite d'outils axés sur les données, conçus pour les fournisseurs de sciences de la vie, afin de les aider à améliorer leurs stratégies de marketing et de découverte électronique.
Bioz fournit également une extension Chrome, un assistant propulsé par l'IA. Cet outil aide les chercheurs en temps réel : il détecte les mentions de produits sur les pages Web et dans le navigateur, les relie aux preuves sous-jacentes et donne aux utilisateurs un accès direct aux données pertinentes sans perdre le contexte de navigation.
IA et technologie
L'approche de Bioz repose sur une combinaison d'IA générative, d'apprentissage profond et d'architectures de réseaux neuronaux. Les fondateurs décrivent la technologie comme étant comparable à la création d'un Google pour les expériences en sciences de la vie, mais avec la capacité de comprendre le contexte d'utilisation des produits. Au lieu de simplement renvoyer tous les articles mentionnant un produit, le système de Bioz identifie des éléments spécifiques, tels que les méthodes d'une étude, le type de test, l'espèce utilisée et les résultats expérimentaux pertinents.
Pour ce faire, Bioz développe et utilise des modèles personnalisés qui traitent les PDF en texte intégral et les transforment en JSON structuré de métadonnées expérimentales. Cela inclut des détails tels que les paires d'agents, les réactifs, les équipements et les conditions expérimentales spécifiques. En interne, l'entreprise qualifie ses cibles de « modèles d'apprentissage automatique profonds », formés sur des articles accessibles au public et sur des ensembles de données propriétaires générés et étiquetés par une équipe de scientifiques.
Bioz a été reconnue par la communauté de l'IA : en 2019, l'entreprise a remporté le défi d'innovation Amazon Hinds, et en 2020, elle a été sélectionnée pour le programme NVIDIA Inception. Ces distinctions ont mis en lumière son utilisation spécialisée du calcul GPU et son application innovante.
Intégration et partenariats
Bioz a noué des alliances avec de grandes institutions et éditeurs. En 2019, elle a annoncé un partenariat avec la plateforme Nature Publishing Group pour fournir les données sous-jacentes d'un nouvel outil de découverte en sciences de la vie. L'année suivante, l'entreprise a collaboré avec Google Cloud pour étendre ses capacités et démontrer la mise à l'échelle de ses flux de travail d'IA basés sur le cloud.
En 2021, Bioz a introduit une intégration avec MilliporeSigma, un important fournisseur de sciences de la vie, permettant à l'entreprise de connecter son score Bioz au site du fournisseur afin que les clients puissent voir les performances prédictives d'un article. Ce partenariat a été important pour façonner le modèle commercial de l'entreprise, qui est passé de la vente aux places de marché et aux fournisseurs à l'utilisation de leurs données pour des recommandations de produits ciblées.
La plateforme dessert également des institutions universitaires et des biotechs. Ses utilisateurs comprennent des groupes de recherche qui souhaitent identifier rapidement le meilleur outil pour une nouvelle expérience, ainsi que des fournisseurs qui veulent savoir comment leurs produits sont cités, afin d'améliorer leurs stratégies de marketing.
Financement et croissance
Bioz a levé 20 millions de dollars, selon les documents publics. Son premier tour de financement majeur a eu lieu en 2016 sous forme de financement d'amorçage, avec des contributions d'investisseurs privés. En 2019, l'entreprise a complété un tour de série A de 12,5 millions de dollars mené par Intel Capital. En 2023, Bioz a levé un montant supplémentaire non divulgué, portant son total à environ 20 millions de dollars.
L'entreprise a des bureaux aux États-Unis et en Israël, où se trouve son équipe de recherche et développement. Son siège social est situé à Los Altos, en Californie.
Défis
L'un des défis que Bioz aborde est la nature vaste et non structurée de la littérature en sciences de la vie. Les études publiées omettent souvent des détails précis, tels que la concentration exacte, le fournisseur ou le numéro de catalogue des produits, ce qui rend difficile la reproduction des expériences. L'IA de Bioz travaille à combler ces lacunes, en combinant l'extraction de texte avec des connaissances spécialisées pour générer des métadonnées structurées. Cependant, la qualité des données extraites reste une préoccupation pour l'avenir, tout comme les approches minutieuses de validation de l'exactitude des résultats de ses modèles.
Un autre défi consiste à intégrer ses scores propriétaires dans le domaine de la recherche en évolution rapide. Bioz apprend en continu des articles nouvellement publiés, ce qui signifie que ses modèles de notation peuvent s'améliorer au fil du temps. Cependant, des questions subsistent quant à la mesure dans laquelle les performances passées d'un produit prédisent son utilité future dans une expérience, ainsi que sur l'interprétabilité de ses scores.
Orientations futures
Bioz est positionnée pour faire partie du mouvement plus large vers la recherche en sciences de la vie pilotée par l'IA. Sa structure de données lui permet de servir de base à d'autres applications, telles que la prédiction de nouvelles utilisations pour des médicaments ou des lignées cellulaires existants, et elle est un composant du produit. À mesure que le domaine de l'IA se développe, il est probable que Bioz soit perçue par la communauté comme un outil de flux de travail, en particulier pour les environnements automatisés à haut débit. L'entreprise cherche à poursuivre sa croissance et sa combinaison de partenariats avec de grands fournisseurs de cloud et des fournisseurs grand public.
L'entreprise n'a pas divulgué de plans futurs, mais elle vise à faire progresser sa vision de rendre chaque découverte biomédicale plus rapide et plus reproductible. Ce faisant, elle s'inscrit dans l'écosystème d'OpenAI.
Voir aussi
- Portail de la biologie
- Apprentissage automatique en bioinformatique
- OpenAI et ses applications
- Google DeepMind