Bioz ist eine kommerzielle Plattform, die künstliche Intelligenz auf die Entdeckung und Interpretation wissenschaftlicher Literatur in den Biowissenschaften anwendet. Das 2013 gegründete Unternehmen mit Sitz in Los Altos, Kalifornien, entwickelt Software-Tools, die Forschern helfen sollen, Reagenzien, Protokolle und experimentelle Produkte aus veröffentlichten Studien zu identifizieren. Das primäre Ergebnis der Plattform ist eine durchsuchbare Datenbank biologischer und chemischer Produkte, die jeweils mit Belegen aus Volltextartikeln annotiert sind und für den experimentellen Kontext strukturiert wurden.
Das Unternehmen wurde von Karin Lachmi, die als CEO fungiert, und Ori Perlman, der als CTO fungiert, gegründet. Vor Bioz arbeitete Lachmi in der akademischen Forschung und war Mitbegründerin eines Genetik-Startups, was ihr Ziel prägte, ein Tool zu entwickeln, das die Hürden bei der Suche nach zuverlässigen experimentellen Materialien verringert. Perlman hatte einen Hintergrund in Softwareentwicklung und Datenanalyse. Das Unternehmen sammelte etwa 20 Millionen US-Dollar über mehrere Finanzierungsrunden ein, mit Investoren wie Intel Capital, das sich 2019 an einer Runde über 12,5 Millionen US-Dollar beteiligte.
Bioz konzentriert seine Technologie auf das Problem der experimentellen Reproduzierbarkeit. Millionen von Forschungsarbeiten enthalten versteckte oder unvollständige Beschreibungen von Produkten, was es Wissenschaftlern erschwert, Ergebnisse zu reproduzieren. Bioz durchsucht den Volltext von Publikationen und verwendet maschinelles Lernen und andere Deep-Learning-Techniken, um Erwähnungen von Produkten wie Reagenzien, Antikörpern, Kits und Ausrüstung zu extrahieren und zu analysieren. Anschließend bewertet es diese Produkte, um ihre vorhergesagte Wahrscheinlichkeit zu zeigen, in einem bestimmten experimentellen Kontext zu funktionieren.
Plattform und Technologie
Die Bioz-Plattform indexiert zig Millionen von Datenpunkten aus über 25 Millionen Artikeln der Lebenswissenschaften. Unter Verwendung von Large Language Models und anderen KI-Ansätzen verarbeitet sie die Artikel, um Produktnamen, deren Beziehungen zu Protokollen und die Ergebnisse von Experimenten zu identifizieren. Das System integriert Suchwerkzeuge, die es Forschern ermöglichen, eine Abfrage einzugeben, und die KI generiert Ergebnisse, die über einfaches Schlüsselwort-Matching hinausgehen. Sie ordnet diese Treffer nach einem proprietären „Bioz Score“, der die vorhergesagte Qualität der Belege für jedes Produkt widerspiegelt, das in einem bestimmten Kontext verwendet wird.
Die Plattform bietet mehrere Schlüsselprodukte an, darunter Bioz Search, Bioz API und Bioz Solutions. Bioz Search ist die kostenlose Weboberfläche, die es Nutzern ermöglicht, Produkte nachzuschlagen und kontextualisierte Ergebnisse zu erhalten, einschließlich Zusammenfassungen von Belegen, die aus Artikeln extrahiert wurden. Die Bioz API ermöglicht es Organisationen, diese Such- und Bewertungsfunktionen in ihre eigenen internen Systeme wie elektronische Labornotizbücher oder Laborinformationsmanagementsysteme zu integrieren. Bioz Solutions ist eine Suite datengesteuerter Tools für Anbieter der Lebenswissenschaften - sie werden verwendet, um deren Marketing und ihre E-Discovery-Strategien zu verbessern.
Bioz bietet auch eine Chrome-Erweiterung an, die ein KI-gestützter Assistent ist. Dieses Tool hilft Forschern in Echtzeit - es erkennt Produkterwähnungen auf Webseiten und im Browser, verknüpft sie mit den zugrunde liegenden Belegen und gibt Nutzern direkten Zugriff auf relevante Daten, ohne ihren Browserkontext zu verlieren.
KI und Technologie
Der Ansatz von Bioz beruht auf einer Kombination aus generativer KI, Deep Learning und Neuronalen Netzwerk-Architekturen. Die Gründer beschreiben die Technologie als ähnlich dem Aufbau eines Google für lebenswissenschaftliche Experimente, jedoch mit der Fähigkeit, den Kontext zu verstehen, wie und wofür Produkte verwendet werden. Anstatt einfach alle Artikel zurückzugeben, die ein Produkt erwähnen, identifiziert das System von Bioz spezifische Dinge - wie die Methoden einer Studie, die Art des Assays, die verwendeten Spezies und experimentelle Ergebnisse, die relevant sind.
Um dies zu erreichen, entwickelt und verwendet Bioz kundenspezifische Modelle, die Volltext-PDFs verarbeiten und in strukturiertes JSON experimenteller Metadaten umwandeln. Dies umfasst Details wie gepaarte Wirkstoffe, Reagenzien, Ausrüstung und die spezifischen experimentellen Bedingungen. Das Unternehmen bezeichnet die Ziele des Systems intern als verschiedene Arten von „Deep Machine Learning Modellen“, die mit öffentlich zugänglichen Artikeln und proprietären Datensätzen trainiert werden, die von einem Team von Wissenschaftlern generiert und beschriftet werden.
Bioz hat Anerkennung aus der KI-Community erhalten: 2019 war das Unternehmen Gewinner der Amazon Hinds AI Innovation Challenge, und 2020 wurde es für das NVIDIA Inception Programm ausgewählt. Diese Ehrungen hoben seine spezialisierte Nutzung von GPU-Computing und seine innovative Anwendung hervor.
Integration und Partnerschaften
Bioz hat Allianzen mit großen Institutionen und Verlagen geschlossen. 2019 kündigte es eine Partnerschaft mit der Plattform der Nature Publishing Group an, um die zugrunde liegenden Daten für ein neues Entdeckungstool für die Lebenswissenschaften bereitzustellen. Im folgenden Jahr arbeitete das Unternehmen mit Google Cloud zusammen, um seine Kapazitäten zu erweitern und die Skalierung seiner cloudbasierten KI-Workflows zu demonstrieren.
2021 führte Bioz eine Integration mit MilliporeSigma ein, einem großen Anbieter für Lebenswissenschaften, die es dem Unternehmen ermöglichte, seinen Bioz Score in die eigene Website des Anbieters zu integrieren, sodass Kunden die vorhergesagte Leistung eines Artikels sehen konnten. Diese Partnerschaft war bedeutend für die Entwicklung des Geschäftsmodells des Unternehmens, von Verkäufen an Marktplätze und Anbieter hin zur Nutzung ihrer Daten für gezielte Produktempfehlungen.
Die Plattform bedient auch akademische Einrichtungen und Biotech-Unternehmen. Zu ihren Nutzern gehören Forschungsgruppen, die schnell das beste Werkzeug für ein neues Experiment identifizieren möchten, sowie Anbieter, die wissen möchten, wie ihre Produkte zitiert werden, um ihren Marketingteams Belege zu liefern.
Finanzierung und Wachstum
Bioz sammelte laut öffentlichen Aufzeichnungen 20 Millionen US-Dollar ein. Seine erste große Finanzierungsrunde war 2016 eine Seed-Runde mit Beiträgen privater Investoren. 2019 schloss das Unternehmen eine Serie-A-Runde über 12,5 Millionen US-Dollar unter der Leitung von Intel Capital ab, die als Investition in KI für die Lebenswissenschaften bekannt wurde. 2023 sammelte Bioz eine weitere, nicht genannte Runde ein, wodurch sich seine Gesamtsumme auf etwa 20 Millionen US-Dollar erhöhte.
Das Unternehmen hat Büros in den USA und in Israel, wo sich sein Forschungs- und Entwicklungsteam befindet. Sein Hauptsitz befindet sich in Los Altos, Kalifornien.
Herausforderungen
Eine der Herausforderungen, die Bioz angeht, ist die breite und unstrukturierte Natur der lebenswissenschaftlichen Literatur. Veröffentlichte Studien lassen oft präzise Details aus, wie die genaue Konzentration, den Anbieter oder die Katalognummer der Produkte, was die Reproduktion von Experimenten erschwert. Die KI von Bioz arbeitet daran, die Lücken zu füllen, indem sie Textextraktion mit Fachwissen kombiniert, um strukturierte Metadaten zu generieren. Die Qualität der extrahierten Daten bleibt jedoch ein Anliegen für die Zukunft, ebenso wie die sorgfältigen Ansätze zur Validierung der Genauigkeit seiner Modellausgaben.
Eine weitere Herausforderung ist die Integration seiner proprietären Bewertungen in das sich schnell verändernde Forschungsfeld. Bioz lernt kontinuierlich aus neu veröffentlichten Artikeln, was bedeutet, dass sich seine Bewertungsmodelle im Laufe der Zeit verbessern können. Dennoch bleiben Fragen offen, inwieweit die vergangene Leistung eines Produkts seinen zukünftigen Nutzen in einem Experiment vorhersagt und wie interpretierbar seine Bewertungen sind.
Zukünftige Richtungen
Bioz ist positioniert, um Teil der breiteren Bewegung hin zu KI-gesteuerter lebenswissenschaftlicher Forschung zu sein. Seine Datenstruktur ermöglicht es, als Grundlage für andere Anwendungen zu dienen, wie der Vorhersage neuartiger Verwendungen für bestehende Medikamente oder Zelllinien, und ist ein Bestandteil des Produkts. Da das KI-Feld wächst, ist es wahrscheinlich, dass Bioz als Workflow-Tool in der Community wahrgenommen wird, insbesondere für automatisierte Hochdurchsatz-Umgebungen. Das Unternehmen strebt weiteres Wachstum und die Kombination von Partnerschaften mit großen Cloud-Anbietern und Mainstream-Anbietern an.
Das Unternehmen hat keine Pläne für die Zukunft offengelegt, zielt jedoch darauf ab, seine Vision voranzutreiben, jede biomedizinische Entdeckung schneller und reproduzierbarer zu machen. Dabei hört es auch auf das OpenAI-Ökosystem.
Siehe auch
- Biologie-Portal
- Maschinelles Lernen in der Bioinformatik
- OpenAI und seine Anwendungen
- Google DeepMind